In een wanhopige oorlog tegen een meedogenloze vijand, waarbij het voortbestaan van de aarde op het spel staat, is er maar een manier om die vijand te verslaan: een van hen worden. Zwaarbewapend en geholpen door een elitebrigade mariniers trek je naar het hart van het kwaad: de thuisplaneet Strogg, om het gevecht daar voort te zetten. Jij bent de enige die de aarde nu nog kan redden in QUAKE 4™.