本作の戦闘はターン制とリアルタイムを融合した、｢タイムシェアード リアルタイムバトルシステム｣を採用。
最大 3 キャラクターまでが参加できるチームバトルになります。ターンが回ってきた（アクティブ状態にある）キャラクターはプレイヤーが操作でき、一定時間バトルフィールド内を自由に行動できます。
このように自由且つ戦略的に行われる戦闘は、わかりやすく、爽快感溢れるシーンを演出します。

本作のキーとなっている“光”と“闇”は戦闘においても重要な要素。必殺技には光と闇の技があり、技発動時のキャラクターの立ち位置が日向か日影かにより決定します。必殺技は1ボタンで簡単に出せるので、リアルタイムバトルの爽快感は残しつつ、フルリアルタイムバトルよりも初心者に優しいシステムです。

“光”と“闇”の要素が影響するのは、プレイヤーキャラだけではありません。 「モンスターモーフィング」システムにより、敵キャラも立ち位置が日向か日影かによって外見はもちろんのこと、強さや名前、必殺技なども全く違う敵に変化します。

各キャラクターのレベルとは別にパーティ全体の能力を表すパーティクラスが存在します。 物語の進行により、ある特定のボスキャラクターを倒すことでパーティクラスがレベルアップしていきます。
パーティクラスのレベルが上がると、シンキングタイム（ターンが回ってきたキャラの行動を考える時間）がなくなったり、行動時間のカウントがリアルタイムになる等、各レベルに応じて戦闘時のルールが変わり、ルールに合わせた変化のある戦闘を楽しむことが出来ます。
また、キャラクターにも変化があり、移動速度が上がったり、反撃が出来るようになるなど、戦闘ルールの変化とキャラクター行動の変化により、さらに戦略性の高い戦闘が出来るようになります。

パーティクラスがレベルアップすると、必殺技の効果を増大させる「エコー」をためることが可能になります。 敵に攻撃を当ててヒット数をためるとエコーが増えていき、必殺技を使用すると自動的にエコーは消費され、必殺技の威力を増大させます。エコーはパーティ全体でためることが出来、キャラクターからキャラクターに引継ぐことができます。エコーが多いほど必殺技の効果が上がり、敵に与えるダメージや回復の効果が上がるので、どこで使うかを見極めましょう。

パーティクラスがレベルアップしていくと、必殺技をつなげる「ハーモニーチェイン」が可能になります。 エコーを一定量ためた状態で必殺技を出したとき、技の終了間際にタイミングよくボタンを押すと、別の必殺技を続けて繰り出す「ハーモニーチェイン」を発動することができます。 パーティクラスが上がっていくと、つなげられるハーモニーチェイン数が増えていき、他キャラクターとも必殺技をつなげることが可能となります。

ゲームを進めていくと、様々な場所でスコアピース（楽譜のかけら）を手に入れることがあります。このスコアピースを集めていくと、街の人たちとセッション（ミニ演奏会）をすることができ、セッションが上手く成立すると、演奏の評価によってレアアイテムを入手できます。

戦闘中、ビートは必殺技の「ビビッドショット」で敵の写真を撮ることができます。撮った写真は戦闘終了後にメニューで閲覧でき、出来によって自動的に評価が付きます。 また、撮った写真はお店で売ることができ、高い評価の写真ほど、高値で売れます。