Ninja Blade™ è un gioco di azione e avventura ambientato nella Tokyo dei giorni nostri. Parassiti noti con il nome di vermi alfa sono misteriosamente apparsi, scatenando un'ondata di distruzione del genere umano nel loro rapido spostamento verso oriente, fino a raggiungere la città Tokyo. Mentre il futuro dell'umanità è in bilico sull'orlo di un baratro, viene formato un esclusivo team scelto e altamente specializzato, la cui missione è contrastare l'attacco nemico e salvare l'uomo dall'annientamento.