Fremtidens soldat vender tilbage i Tom Clancy's Ghost Recon Advanced Warfighter™ 2. Året er 2014, og spøgelserne er tilbage for at imødegå en overhængende trussel ved den netop færdiggjorte mur langs den mexicansk/amerikanske grænse. Spøgelserne har et opgraderet Integrated Warfighter System (IWS), men de har kun 72 timer til at evaluere truslen og forhindre den i at nå amerikansk jord.