På aftenen for den cubanske revolution tager et større mafiamøde i Havana en blodig drejning i The Godfather® II. Din families Don bliver dræbt på Cuba, og du skal tage tøjlerne og lede den sønderknuste organisation, så Corleone-magtcentret i Queens kan retableres. Succes avler muligheder, så Hyman Roth opfordrer dig til at ekspandere og støtte ham i South Florida, hvorved der lægges op til vigtige beslutninger om langsigtede alliancer. Da Michael Corleone kommer under efterforskning af en senatskomité for organiseret kriminalitet, udpeges du til at lede familien, og Tom Hagen bevæger sig ind i organisationen.

Opbyg dit arsenal, kommander tropperne, etabler dine kriminelle kredse, og prop dine lommer med tjenester fra magtpersoner, mens du afværger angreb og hævner dig på dine rivaler. The Godfather har altid en pris på sit hoved og en skydeskive på ryggen, men tag det ikke personligt.Det er, når alt kommer til alt, kun business.